1. 先分清楚「重複」的意思
位元組完全相同，表示檔案資料完全一致。單純更名的副本仍可能完全相同，重新編碼匯出的影片通常則不是。視覺重複是指完整畫面內容相符，即使檔案資料有所不同。
短片段出現在較長影片中，屬於片段相符，不代表兩個完整檔案重複。只有片頭或某個場景相同的影片，也要與完整內容相符區分。MediaDNA Library 會分開呈現這些關係，方便核對。
2. 準備要比對的資料夾
連接相關本機硬碟、外接硬碟或已掛載的 NAS 資料夾，將資料夾加入 MediaDNA Library，並等待索引完成。原始檔案保留在原處；建立索引不會產生備份。
先在活動頁檢查索引進度與讀取問題，再到所有檔案核對位置及可用狀態。若要比較工作素材與備份，兩邊的資料夾都要納入。遺失或未建立索引的素材，不能視為已完成檢查。
3. 核對素材庫中的完整相符結果
索引完成後開啟重複檔案，逐組查看預覽、檔案位置及可用狀態。檔名、檔案大小或解析度不同，本身不足以判斷完整畫面內容是否相符。
練習時可選一小組自己的影片，另存一份不同檔名的副本。將兩個位置建立索引，再查看是否出現相符群組並核對路徑。若也加入重新編碼版本或短片段，請檢查實際結果，不要預先認定三者都屬於同一組重複檔案。
4. 加入新檔案前，先檢查是否已收藏
在加入新影片所在資料夾前，先到內容搜尋選取該影片。查詢檔案只供本次搜尋使用，不會自動建立索引。核對通過完整內容驗證的結果，即可查看既有副本的位置。
如果目的是在較長影片中找出短片段，請繼續進行片段搜尋並核對回傳的時間範圍。片段結果能協助找回素材，但不能作為移除其中一部完整影片的重複依據。
5. 決定要保留哪些版本
檢查畫質，以及創作需要的音軌和字幕軌。同時確認檔案位置、能否存取，以及另一份是否為刻意保留的備份。完整畫面相符，不代表系統已替你選出最適合的版本。
你可以保留所有副本。移除是選用操作，需要自行選取並確認。本機檔案通常移至系統垃圾桶；網路檔案可能需要永久刪除。請閱讀確認提示，並在移除仍可能需要的素材前保留獨立備份。
6. 預期的相符結果沒有出現時
先檢查素材庫範圍：資料夾是否已加入、硬碟是否連接，以及索引是否完成且沒有讀取錯誤。尚未建立索引的檔案，不會因為儲存裝置上有另一份副本就出現在結果中。
大幅裁切、疊加圖層或剪輯可能增加比對難度。只有局部相同的內容應使用片段搜尋，不應視為完整重複。找不到結果，不能證明影片獨一無二、為原創或可自由再利用。